Chuyên gia tin sinh học

Lịch làm việc

Chuyên gia tin sinh học thường làm việc toàn thời gian tại các phòng thí nghiệm nghiên cứu, bệnh viện, công ty dược phẩm hoặc công ty công nghệ sinh học. Hầu hết đều làm việc theo giờ hành chính, nhưng thời hạn dự án đang đến gần hoặc yêu cầu dữ liệu khẩn cấp - đặc biệt là trong môi trường lâm sàng hoặc nghiên cứu nhịp độ nhanh - có thể dẫn đến việc phải thức khuya hoặc làm việc cuối tuần, đặc biệt là khi cộng tác với các nhóm quốc tế hoặc ứng phó với các cuộc khủng hoảng y tế.

Nhiệm vụ tiêu biểu

• Viết mã và xây dựng các mô hình tính toán để phân tích dữ liệu di truyền, protein hoặc lâm sàng.
• Hợp tác với các nhà sinh vật học và bác sĩ để định hình các vấn đề khoa học dưới dạng câu hỏi dữ liệu.
• Làm sạch, sắp xếp và giải thích các tập dữ liệu sinh học lớn bằng cách sử dụng thống kê và máy học.
• Tạo hình ảnh trực quan để giúp các nhà khoa học hoặc bác sĩ lâm sàng hiểu được những phát hiện phức tạp.
• Phát triển các công cụ và cơ sở dữ liệu để lưu trữ và truy cập dữ liệu sinh học một cách hiệu quả.

Trách nhiệm bổ sung

• Cập nhật thông tin về công nghệ giải trình tự và phương pháp phân tích mới bằng cách tham dự hội thảo hoặc hội nghị.
• Ghi chép cẩn thận quy trình làm việc và kết quả để xuất bản khoa học, tuân thủ quy định hoặc sử dụng trong lâm sàng.
• Hướng dẫn sinh viên sau đại học, nhà phân tích mới vào nghề hoặc thực tập sinh về phương pháp tin sinh học.
• Đóng góp vào phần mềm nguồn mở hoặc giúp duy trì cơ sở dữ liệu dùng chung được cộng đồng nghiên cứu sử dụng.
• Trình bày những phát hiện tại các cuộc họp khoa học hoặc trước những đối tượng không phải là chuyên gia kỹ thuật.

Buổi sáng thường bắt đầu bằng việc xem lại email và kiểm tra các lần chạy dữ liệu qua đêm để tìm lỗi hoặc đột phá. Sau cuộc họp nhóm để xác định các ưu tiên, bạn có thể khắc phục sự cố mã, chạy căn chỉnh trình tự hoặc thảo luận chiến lược nghiên cứu với các nhà sinh học. Buổi trưa có thể bao gồm việc phân tích kết quả thí nghiệm hoặc chuẩn bị tệp cho cộng tác viên ở nửa bên kia địa cầu.

Buổi chiều thường là thời gian làm việc chuyên sâu hơn: xây dựng thuật toán mới, tạo hình ảnh hóa dữ liệu hoặc chuẩn bị số liệu để xuất bản. Một số ngày, các chuyên gia tin sinh học trình bày kết quả nghiên cứu, tham dự hội thảo kỹ thuật hoặc làm việc chặt chẽ với các nhóm y tế. 

Kỹ năng mềm:

• Tư duy phân tích
• Giải quyết vấn đề
• Giao tiếp (dịch các phát hiện kỹ thuật cho người không chuyên)
• Hợp tác
• Kiên nhẫn và kiên trì
• Sáng tạo
• Chú ý đến chi tiết
• Khả năng thích ứng
• Quản lý dự án

Kỹ năng kỹ thuật:

• Lập trình (Python, R, Perl, Java hoặc C++)
• Phân tích và trực quan hóa dữ liệu
• Mô hình thống kê
• Máy học
• Kiến thức về giải trình tự và di truyền học (NGS, RNA-seq, v.v.)
• Quản lý cơ sở dữ liệu (SQL, NoSQL)
• Điện toán đám mây và các công cụ dữ liệu lớn
• Thành thạo dòng lệnh Linux
• Dọn dẹp dữ liệu và đảm bảo chất lượng
• Kiến thức về các công cụ tin sinh học (BLAST, GATK, Bioconductor, v.v.)

• Tập trung vào nghiên cứu: Thiết kế các phương pháp tính toán mới, phát triển thuật toán và xuất bản các bài báo khoa học
• Chuyên gia tin sinh học lâm sàng: Phân tích mẫu bệnh nhân, hỗ trợ xét nghiệm di truyền và giúp chẩn đoán bệnh
• Chuyên gia ngành/dược phẩm: Làm việc trong lĩnh vực khám phá thuốc, thử nghiệm lâm sàng hoặc phát triển sản phẩm cho các công ty công nghệ sinh học
• Người quản lý cơ sở dữ liệu: Xây dựng, tổ chức và duy trì các nguồn dữ liệu thiết yếu cho cộng đồng nghiên cứu toàn cầu

• Phòng thí nghiệm nghiên cứu học thuật
• Bệnh viện và trung tâm nghiên cứu gen lâm sàng
• Các công ty công nghệ sinh học và dược phẩm
• Các cơ quan chính phủ (NIH, CDC)
• Các tổ chức y tế phi lợi nhuận
• Các công ty tư vấn tin sinh học tư nhân

Các chuyên gia tin sinh học thường giải quyết những vấn đề khó khăn không dễ dàng tìm được lời giải. Bạn được kỳ vọng sẽ theo kịp công nghệ thay đổi nhanh chóng và xử lý nhiều dự án cùng lúc—đôi khi với tiến độ gấp rút hoặc rất nhiều lần thử nghiệm và sai sót. Làm việc nhiều giờ có thể là điều bình thường khi một bước đột phá sắp đến hoặc một đối tác lâm sàng cần kết quả nhanh chóng.

Công việc có thể trở nên khó khăn khi một tập lệnh không chạy được hoặc dữ liệu của dự án trở nên lộn xộn, nhưng việc thấy phân tích của mình tác động trực tiếp đến nghiên cứu hoặc chăm sóc bệnh nhân là điều hoàn toàn xứng đáng. Bước vào một lĩnh vực tiên tiến của khoa học và công nghệ đồng nghĩa với việc luôn có nhiều điều để học hỏi—và cũng là vô vàn cơ hội để tạo nên sự khác biệt.

Tin sinh học đang phát triển nhanh chóng! Điện toán đám mây và trí tuệ nhân tạo đang giúp các nhà nghiên cứu phân tích các tập dữ liệu lớn nhanh hơn bao giờ hết. Các công cụ giải trình tự tế bào đơn, hệ gen không gian và hệ protein đang mở ra những tầng phức tạp mới trong sinh học. Việc chia sẻ dữ liệu, khoa học mở và đảm bảo kết quả có thể tái tạo được đang được chú trọng. Với sự phát triển của y học cá nhân hóa, các nhà tin sinh học đóng vai trò trung tâm trong việc điều chỉnh phương pháp điều trị cho từng bệnh nhân. Quyền riêng tư và đạo đức dữ liệu cũng đang trở nên quan trọng khi ngày càng nhiều dịch vụ chăm sóc sức khỏe chuyển sang lĩnh vực kỹ thuật số.

Nhiều người thích lập trình, giải đố, chơi trò chơi logic hoặc xây dựng đồ vật bằng công nghệ. Một số người say mê DNA hoặc di truyền học ở trường, hoặc yêu thích toán học, thống kê hoặc hội chợ khoa học. Những người khác thích sắp xếp thông tin, đào sâu vào các vấn đề phức tạp, hoặc giúp người khác hiểu các khái niệm khó hiểu thông qua những lời giải thích rõ ràng.